Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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