Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ctdnep1Q3TP92 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms