Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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