Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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