Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprkP35822 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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