Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Kif3aP28741 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms