Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RxraP28700 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms