Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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