Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Opn1mwO35599 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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