Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm3002E9PW72 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms