Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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