Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Col5a3Q9JLI2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms