Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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