Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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