Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Atg3Q9CPX6 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms