Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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