Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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