Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms