Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Chd1P40201 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Chd1P40201 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Chd1P40201 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms