Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Hoxd9P28357 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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