Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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