Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Spta1P08032 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms