Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
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