Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Sp100O35892 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms