Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms