Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Tmf1B9EKI3 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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