Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Speer3W4VSP1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms