Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Hdac6Q9Z2V5 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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