Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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Rnft1Q9DCN7 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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