Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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