Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Amigo3Q8C2S7 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms