Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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