Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc18Q640L5 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms