Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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