Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp39Q3TIX9 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms