Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms