Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Irx1P81068 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms