Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprmP28828 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprmP28828 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PtprmP28828 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PtprmP28828 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms