Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxb2P0C1T1 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms