Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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Ccl20O89093 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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Ccl20O89093 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Ccl20O89093 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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