Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ccdc6D3YZP9 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms