Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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