Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cldn7Q9Z261 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cldn7Q9Z261 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms