Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Trim12aQ99PQ1 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Trim12aQ99PQ1 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Trim12aQ99PQ1 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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