Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms