Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Znf48Q3US17 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Znf48Q3US17 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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