Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox12Q04890 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox12Q04890 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Sox12Q04890 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sox12Q04890 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms