Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Mc1rQ01727 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms