Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
BckdhaP50136 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms