Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LmnaP48678 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms